2006年，“胡须男”纳迪姆在一个朋友聚会上认识孙燕姿，开始猛烈追求。他坦言追了孙燕姿整整9个月。纳迪姆原本在香港公司，为了维护恋情，主动从香港转到新加坡任职，以求朝夕相处。

2007年7月，孙燕姿被拍到跟“胡须男”在香港一起喝糖水。同年10月，孙燕姿担任郑秀文演唱会的嘉宾，与“胡须男”同坐一排。虽然孙燕姿向来在传媒面前对男友只字不提，但她在家人和朋友面前却畅所欲言。

2010年2月，孙燕姿在香港红馆举行两场个唱，其男友随孙爸爸同进同出。2011年2月，孙燕姿上《康熙来了》时称已见过男友爸妈。2011年4月，孙燕姿宣传新专辑时称“是时候”就结婚。

2007年5月25日，纳迪姆邀孙燕姿到香港玩，当晚就被香港媒体拍到。二人到香港中环IFC戏院看电影，散场后又到超市买东西，二人并无亲密互动。孙燕姿一直不回应恋情，坚决拒绝男友到台湾陪她工作、探班。

2009年4月初，孙燕姿现身某铁人三项赛的现场，为她的“胡须男”助威。4月12日，孙燕姿到台湾为演唱会做宣传，终于承认“胡须男”的男友身份。孙燕姿当天还表示，二人关系稳定，不排除闪婚的可能。

2011年4月12日，新加坡媒体报道，孙燕姿在3月31日已和男友纳迪姆秘密结婚。孙燕姿所属的唱片公司表示，孙燕姿仅是根据新加坡法律规定，先在网络上登记申请结婚，还不算正式结婚。

孙燕姿的初恋发生在大学阶段，她和年长一岁、180公分高的学长交往两年。有天学长到她家，突发奇想要将孙燕姿放进箱子里面。箱内的她害怕极了，嘶吼着求救，他才把箱子打开。这场恶作剧种下两人分手的导火线，她也因而有了密室恐惧症。

2003年5月，孙燕姿与丹尼斯在新加坡逛街被跟拍，一气之下主动公开恋情。2005年8月，他和孙燕姿一起到夜店玩，被媒体偷拍。丹尼斯是燕姿出道以来第一个公开承认的男朋友，也是因为分手才被公开名字的。

陈正刚曾经是华纳前宣传部经理，他也是最有福气的一个，他喜欢孙燕姿而且能长期待在她的身边。此前，孙燕姿还被目击和“痴情男”当街拥抱，而陈正刚还被指暗恋孙燕姿4年。

2007年，"胡须男"纳迪姆男友身份被确定。他是亚裔荷兰人，目前担任某公司市场行销主管。今年3月31日，孙燕姿和纳迪姆到婚姻注册局登记结婚。