本届金马奖入围名单公布后，金马奖接获香港美亚电影制作有限公司来函表示，当初进行报名作业时，因公司内部作业疏失，将《PTU》导演奖项误植为杜琪峰、韦家辉两位，然该部影片实际导演仅有杜琪峰一人，因此请求金马奖更正此一疏失，将“最佳导演”入围者更正为杜琪峰一人。

另，经金马奖向“果昱影像制作有限公司”查证，确认原以《飞跃情海》同时入围“最佳新演员”与“最佳女主角”的林依晨，在本届参赛作品《飞跃情海》之前，已参与电影《空手道少女组》之演出，并担任主要角色，不符合金马奖报名简章明订"角逐“最佳新演员”者，“须为第一次演出电影，并担任主、配角之新进演员”"规定。故经全体评审委员一致同意后，决议取消其“最佳新演员”奖项之入围资格，“最佳女主角”奖项入围资格则不受影响。而“最佳新演员”奖项入围人数则减为三名，不另行递补。

金马奖对报名影片公司的作业疏失深表遗憾，并祝福深具演艺潜质的林依晨能不受此一结果影响，依旧在演艺事业上展现亮丽的演出。

本届金马奖入围名单更正如下：

最佳导演(入围四名)

刘伟强、麦兆辉《无间道》寰亚电影有限公司

彭浩翔《大丈夫》无休映像有限公司美亚电影制作有限公司

蔡明亮《不散》?乃古霖电影有限公司

杜琪峰《PTU》美亚电影制作有限公司

最佳新演员(入围三名)

张捷《不见》?乃古霖电影有限公司

郑智允《跑吧！孩子》星霖电影公司

王宝强《盲井》盛唐电影制作有限公司